В далёком 1988 году четверо музыкантов, спрятавшись под нечестивыми псевдонимами: Captain Death (Spyros) (ударные - ex-Vomit и Sound Polution), Mutilator(Jim) (бас - ex-Rotting Christ), John (гитара - ex-Danger Cross) и Necroabyssious (Stephan) (вокал - ex Sickness Mind ), - объединили свои тёмные усилия под флагом Varathron. Итогом множества репетиций явилось легендарное демо "Procreation of the Unaltered Evil", записанное в октябре 1989 года. Запись была ужасного качества, зато очень богохульная. В те времена это было что-то особенное. Лента мгновенно привлекла к себе внимание.
В следующем году ушёл Captain Death и его место занял Themis (Rotting Christ). Дополнив состав вторым гитаристом Stavros, группа отправилась в студию записывать демо "Genesis of Apocryphal Desire". Месяц спустя настала очередь ЕР "One Step Beyond Dreams". Всего было выпущено тысяча дисков, каждый из которых был пронумерован вручную. Весь тираж был распродан в течение нескольких недель. Группе всего было три года отроду, когда она уже с полным правом могла называться культовой. Это было время легенд. Black Metal поднимал голову по всему миру. В Греции андерграунд рожал культовые релизы один за другим. Одним из таких релизов был сплит-альбом "Black Arts Lead To Everlasting Sins", который содержал материал групп Varathron и Necromantia.
Varathron с легкостью получили хороший контракт. Просмотрев множество достойных предложений, музыканты выбрали голландский лэйбл Cyber Music Records, который в конце 1993 года выпустил дебютный полноформатный альбом под названием His Majesty At The Swamp. Альбом был великолепен, настоящий шедевр. Он был записан за лето 1993 года с новыми участниками - единственным гитаристом Necroslaughter и драммером Wolfen.
Неожиданно из группы соскочил Mutilator, а за ним и Necroslaughter, уехавший в Австралию на ПМЖ, чтобы вместе с братом играть там в группах Agatus и Zemial.
Казалось, Varathron обескровлен и почти мёртв, но Necroabyssious - единственный оригинальный участник группы, нашел новых музыкантов. Отныне в группе играли Wolfen, Pyrphoros (гитары и бас, ex-Kawir), Adrastos (клавиши). Группа записала второй альбом "Walpurgisnacht", выпущеный греческим Unisound Records. Материал был в лучших традициях мрачного блэка, который культивировал Varathron. Главной особенностью этого альбома стало участие клавишника в записи. Как следствие, звучание приобрело дополнительную глубину и атмосферность. К сожалению, реклама этого релиза оставляла желать лучшего.
В 1997 году лэйбл Cursed Productions выпускает на CD материал двух демо группы с тремя ранее неиздававшимися песнями в качестве бонуса.
Спустя два года группа получает контракт с крупным польским лэйблом Pagan Records и приступает к студийной работе. Приступает, по традиции, в новом составе. Нового клавишника звали Bill, в андерграундных кругах он известен больше как Crazy Wizard. Результатом работы в студии стал мини-альбом "The Lament Of Gods". На диске содержалось 4 новых песни, а также кавер на песню "Nuns Have No Fun" группы Mercyful Fate. Все звучало очень блэк-металлически и атмосферно.
Вторым релизом Varathron на Pagan Records стало переиздание альбома "His Majesty At The Swamp" на CD и виниле с одним бонус-треком. Практически одновременно с этим лэйбл Ordealis Records издает две ранних демо-записи группе на виниле, а лэйбл Mutilation Records выпускает двойной CD с материалом обоих полноформатных альбомов группы и миньона "The Lament Of Gods". Вот так, не записав за три года ничего нового, Varathron обзавелись кучей релизов.
Впрочем, новый материал все-таки появился. Позже. Новый альбом также записывался в новом составе. Теперь гитарными и басовыми партиями заведовал Achilleas, а за барабанной установкой сидел некто Haris. Материал, который был записан осенью 2004 года, приобрел очертания альбома и был богохульно окрещен "Crowsregn". В декабре 2004 года он вышел на ныне не существующем греческом лэйбле Black Lotus Records, а спустя год был издан на виниле на польском лэйбле Agonia Records. B начале 2006 года Varathron вновь начали давать концерты, впервые более чем за 10 лет.
В 2009 году альбом "Stygian Forces of Scorn" вышел на Die Todesrune Records как на CD, так и ограниченным тиражом в 500 экземпляров на виниле. В декабре того же года Varathron вместе с земляками Desolation выпустили сплит-альбом "Darkness Has Landed"
